Selepas UPSR, murid-murid berpeluang untuk melanjutkan pelajaran ke peringkat sekolah menengah. Pendidikan menengah terbahagi kepada dua peringkat:
Pendidikan Menengah Rendah (Tingkatan 1 hingga Tingkatan 3)
Pendidikan Menengah Atas (Tingkatan 4 hingga Tingkatan 5)
Pendidikan Menengah Rendah
Ini merangkumi Tingkatan 1 hingga Tingkatan 3. Subjek yang akan dipelajari terbahagi kepada berikut:
Subjek Teras
Subjek Pilihan
Bahasa Melayu
Pendidikan Islam
Bahasa Inggeris
Moral
Sains
Kemahiran Hidup:Ekonomi Rumah Tangga
Sejarah
Kemahiran Hidup: Pertanian
Geografi
Kemahiran Hidup: Perdagangan dan Keusahawanan
Matematik
Kemahiran Hidup Bersepadu
Bahasa-bahasa Eropah
Bahasa ibunda
Pilihan subjek pilihan adalah tertakluk kepada kemampuan sekolah. Pada pengajian murid-murid di Tingkatan 3, mereka akan dinilai melalui peperiksaan Penilaian Menengah Rendah (PMR).
Pendidikan Menengah Atas
Setelah tamat Pendidikan Menengah Rendah, murid-murid akan berpeluang melanjutkan pelajaran ke Menengah Atas selama 2 tahun (Tingkatan 4- Tingkatan 5).
Sejak pelaksanaan sijil terbuka, murid-murid perlu mengambil empat subjek wajib iaitu Bahasa Melayu, Bahasa Inggeris, Matematik, Pendidikan Islam atau Moral dan Sejarah.
Terdapat tiga aliran utama dalam pendidikan menengah atas:
Aliran Akademik (Sains/Sastera)
Aliran Teknik dan Vokasional
Aliran Agama
Aliran Sains dan Sastera
Murid yang berminat dalam bidang akademik boleh memilih salah satu antara dua aliran utama. Murid yang berminat dengan sains akan mengambil subjek Kimia, Biologi, Fizik, Matematik Tambahan dan Bahasa Inggeris untuk Sains dan Teknologi (English for Science and Technolgy, EST).
Sekiranya memilih aliran sastera, murid akan memilih sains paduan dan sebarang subjek lain yang tidak berunsur sains seperti perakaunan atau perdagangan.
Aliran Teknik dan Vokasional
Selepas tamat PMR, murid yang berminat berpeluang untuk memilih ke aliran teknik. Antara jurusan yang ditawarkan seperti berikut:
Pengajian Kejuruteraan Mekanikal
Pengajian Kejuruteraan Awam
Pengajian Kejuruteraan Elektrik
Pertanian
Perdagangan
Pengurusan Makanan
Pengajian Pakaian
Murid berpeluang untuk memilih ke aliran vokasional. Antara jurusan yang ditawarkan seperti berikut:
Elektrik
Elektronik
Automotif
Katering
Pengaturcaraan Komputer
Terdapat beberapa sekolah menengah kebangsaan (SMK) yang menawarkan aliran teknikal, tetapi bilangannya terhad dan hanya dua subjek elektif yang ditawarkan iaitu Lukisan Kejuruteraan dan Teknologi Kejuruteraan.
Murid yang meminati jurusan yang ditawarkan mestilah memohon untuk kemasukan ke Sekolah Menengah Teknik secara atas talian.
Pada akhir pengajian tingkatan 5 murid-murid daripada aliran ini akan dinilai melalui peperiksaan SPM.
Peringkat Menengah Rendah: Tingkatan 1 - 3
Mata Pelajaran Teras:
Bahasa Melayu
English Language
Mathematics
Science
Sejarah
Pendidikan Islam
Pendidikan Moral
Pendidikan Sivik dan Kewarganegaraan
Mata Pelajaran Wajib:
Geografi
Pendidikan Jasmani
Pendidikan Kesihatan
Kemahiran Hidup
Pendidikan Seni Visual
Pendidikan Muzik
Mata Pelajaran Tambahan:
Bahasa Cina
Bahasa Tamil
Bahasa Arab
Bahasa Iban
Bahasa Kadazandusun
Bahasa Jepun
Bahasa Perancis
Bahasa Jerman
Peringkat Menengah Atas: Tingkatan 4 - 5
Mata Pelajaran Teras:
Bahasa Melayu
English Language
Mathematics
Science
Sejarah
Pendidikan Islam
Pendidikan Moral
Pendidikan Sivik dan Kewarganegaraan.
Mata Pelajaran Wajib:
Pendidikan Jasmani
Pendidikan Kesihatan
Mata Pelajaran Tambahan:
Bahasa Cina
Bahasa Tamil
Bahasa Arab
Bahasa Iban
Bahasa Kadazandusun
Bahasa Jepun
Bahasa Perancis
Bahasa Jerman
Mata Pelajaran Elektif:
Kesusasteraan Melayu
Literature in English
English for Science and Technology
Pendidikan Seni Visual
Pendidikan Muzik
Geografi
Ekonomi Asas
Additional Mathematics
Additional Science
Physics
Chemistry
Biology
Information and Communication Technology
Reka Cipta
Sains Sukan
Pembinaan Domestik
Membuat Perabot
Seni Reka Tanda
Kerja Paip Domestik
Pendawaian Domestik
Kimpalan Arka dan Gas
Menservis Automobil
Menservis Motosikal
Menservis Peralatan Penyejukan dan Penyamanan Udara